功能性肥料是指除了肥料具有植物营养和培肥土壤的功能以外的特殊功能的肥料。它应该是适合于特定的土壤和作物，且不以特殊功能为主要目的。功能性肥料现在没有一个特别准确的分类。因为是功能性肥料，所以都是按照功能进行分类。有改土型、保水型、促生型、除草型、杀虫型、灭菌型等。除了有营养植物的功能以外，另外所具备的其它功能，我们都应该称为功能性肥料。只有符合四个要件，我们才能把它称作为功能性肥料。第一，本身是能直接提供植物营养所必须的营养元素或者是培肥土壤；第二，必须具有一个特定的对象；第三，不能含有法律、法规不允许添加的物质成份；第四，不能以加强或是改善肥效为主要功能。

功能性肥料不仅是一种新型肥料，而且市场潜力很大。在功能性肥料的定位方面要严格强调三点要求：第一，它必须是肥料的附加功能，不能是主要功能；第二，最好不要是肥料的添加物；第三，不能大幅度增加肥料的成本。

功能性肥料是当前我国肥料行业，尤其是新型肥料发展的关键和重点。传统肥料关注的是提供作物的养分，新型肥料则赋予了肥料更多新型功能。随着功能的不断增加和延伸，出现了水肥一体、药肥一体、种肥一体、肥机一体等发展趋势。这与现代农业需求的综合服务相适应，推动了行业的进步，并成为构建和支撑农业综合生产能力持续发展和不断提高的重要方面。

功能性肥料意在强调肥料的功能。肥料的基本功能是为作物提供营养、改善土壤性质、培肥地力。功能性肥料既具有肥料的基本功能，又具有一些特定的功能。推动和发展功能性肥料是国际、国内肥料发展的大趋势，它是一项多学科、多领域合作的系统工程。

功能肥料一般具有四个特点：

其一，水溶、缓释、把离子态的速效养分缓存在土壤当中，随着作物的吸收再次释放。其二，具有改良土壤的作用，可以蓄能、增加土壤的保湿性、供肥能力。其三，提高肥料利用率，在水肥一体化的情况下，一般功能性肥料利用率可达15%-20%左右。其四，改善农作物的品质，如一些功能肥，其中的表面活性剂能够恢复农作物的生态味道，对作物生长产生很好的效果。

功能性肥料的定位应依据土壤的需求，体现肥料与土壤的和谐。

土壤的生态包括土壤的健康以及土壤健康对作物生长所产生的关联作用。基于目前土壤环境与作物生长的关系越来越密切，我们不仅要关注土壤自身的健康问题，在生态方面更应该注重由土壤健康问题所带来的一些关联因素。作物生长不仅仅是一个单一养分问题，它关系到很多方面，是一个复杂的问题，比如说根系的健康问题、作物的病虫害和营养吸收障碍的问题。